綠色植物用來產(chǎn)生有機質(zhì)的二氧化碳主要來源于土壤，有機肥分解產(chǎn)生的二氧化碳是土壤中二氧化碳的重要來源。有機肥的施用增加了土壤二氧化碳的釋放能力，提供了豐富的可被植物直接吸收利用的二氧化碳養(yǎng)分，從而提高了作物的光合效率，增加了產(chǎn)量。有機物分解產(chǎn)生二氧化碳，綠色植物與二氧化碳光合作用合成有機物的過程在物質(zhì)循環(huán)和生物能量轉(zhuǎn)化中具有重要意義。同時，土壤二氧化碳含量的增加也促進了土壤與外界的氣體交換，提高了土壤的吸收，增加了土壤固、氣、液的協(xié)調(diào)性，為植物生長提供了良好的條件。

有機肥將大量的酶和微生物帶入土壤，為土壤增加了新的活體物質(zhì)，同時為這些活體生物提供了豐富的營養(yǎng)和能量，提高了它們的活性，增強了它們的繁殖能力。土壤的這些生命活動使有機質(zhì)分解轉(zhuǎn)化為養(yǎng)分供植物吸收利用，同時不斷產(chǎn)生全新的化合物，使土壤養(yǎng)分不斷積累。微生物還釋放一些被土壤固定的養(yǎng)分，吸附一些容易淋溶的養(yǎng)分，從而提高土壤的供肥和保肥能力。土壤生命的不斷繁衍，給土壤增加了新的有機物質(zhì)?？傊袡C肥使土壤成為一個充滿活力的生命體，正在進行旺盛的新陳代謝。養(yǎng)分的分解與合成、固定與釋放、積累與消耗，使土壤有機質(zhì)和營養(yǎng)元素不斷增加，土壤的物理、化學(xué)和生物性質(zhì)不斷改良，促進作物健壯生長。