以發(fā)酵有機(jī)肥為載體，添加功能菌，加工成生物有機(jī)肥。生物有機(jī)肥料是指一種含有有益于作物生長的發(fā)酵微生物的特定有機(jī)肥料。既有微生物肥料的作用，又有有機(jī)肥的作用。當(dāng)應(yīng)用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)時(shí)，可以獲得特定的肥料益。生物有機(jī)肥料中添加的微生物肥料也有很多種，根據(jù)其成品中特定微生物的種類可以分為放線菌類，和真菌類；根據(jù)其作用機(jī)理，可分為根瘤菌類、固氮菌、解磷菌、解鉀真菌類；根據(jù)有機(jī)肥中添加的微生物種類的數(shù)量，可分為單一生物有機(jī)肥料與有機(jī)無機(jī)復(fù)混生物有機(jī)肥。
生物有機(jī)肥的作用：

由于微生物種類不同，發(fā)揮的作用也不同。總結(jié)它具有以下功能：

(1)固氮作用，如根瘤和固氮菌，在適宜的環(huán)境條件下可以固化空氣中的氮，為作物生長提供氮素營養(yǎng)。

（2）養(yǎng)分釋放微生物去除土壤中一些難以被作物吸收利用的物質(zhì)分解成作物可以吸收利用的有效營養(yǎng)物質(zhì)。

（3）促生作用土壤施用微生物肥料后，不僅增加了土壤中的養(yǎng)分含量，促進(jìn)了多種維生素、酶和其他有益于作物生長的物質(zhì)的合成，幫助作物吸收養(yǎng)分。

(4)一些微生物接種到具有抗病性的土壤中后，在作物根部大量繁殖。在一段時(shí)間內(nèi)，它成為作物根際的優(yōu)勢菌，控制或減少病原微生物的繁殖。一些微生物也會對病原微生物產(chǎn)生抵抗作用。雖然微生物肥料能為作物生長提供養(yǎng)分并使作物生長，但是畢竟它的作用還是有限的，作物生產(chǎn)主要靠有機(jī)肥提供作物生長所需的養(yǎng)分。

（5）自然界中的許多原料都含有許多有益的微生物，但是一旦這些原料被應(yīng)用進(jìn)入土壤，里面的微生物就會被土壤中無數(shù)的微生物吃掉。因此，不能在土壤中穩(wěn)定生存，其效果難以顯現(xiàn)。然而，如果先加入有益菌添加到發(fā)酵的有機(jī)肥中，有機(jī)肥本身就是一種擴(kuò)大的培養(yǎng)基。這時(shí)，微生物有機(jī)肥料被施入土壤，很快在土壤形成優(yōu)勢種群，可以很好的發(fā)揮作物根系的作用。發(fā)酵有機(jī)肥對發(fā)揮微生物活性具有很好的作用。